蒙医药治疗肝病已经成为的重点专病专科，已获准国家中医药管理局审批立项。此外，传统疗术（五疗）科以简、便、易、廉、疗效显著等特点得到了广大患者的信赖。
于2005年起引进腹膜透析技术，蒙西医结合腹膜透析治疗各种慢性肾病终末期，特别是慢性肾功能不全（尿毒症）的治疗上有了很大的突破，填补了全市在此项技术上的空白，而且有着明显效果 。 近几年 先后派20余名业务骨干到省级医院或大专院校，进修学习 新项目新技术，不断 提高了医护人员的业务素质 。
库伦旗蒙医医院应广大蒙古族群众的强烈要求，近年来，陆续开展了阑尾炎、疝气、胃十二指肠、胆囊、肠梗阻、甲状腺瘤、剖宫产、子宫肌瘤、卵巢囊肿、四肢骨折的内固定术等等手术。
如今，库伦旗蒙医医院在旗委、旗政府及主管局的正确领导下，在团结务实、真抓实干的领导班子带领下，全院上下认真贯彻“科学发展观”、以病人为中心、提高医疗服务质量、医德医风建设，内涵建设，通过实施“树名医、立名科、带名院”的战略，使医院的医疗技术，综合服务能力稳步提高，为库伦旗17万各族群众的身心健康做出新的贡献。
库伦旗蒙医医院院是库伦旗单一一所“以蒙医蒙药为主、蒙医西医相结合”集医疗、科研、制剂、预防为于一体的国家二级医院，是自治区放心药房，市级文明单位，也是库伦旗单一一所蒙医蒙药继续教育基地。作为成立近30年的蒙医蒙药为主的综合性医院。
始建以来，库伦旗蒙医医院始终遵循以“一切为病人、为一切病人、为病人一切、突出特色、全面发展”的原则，遵循发展必有坚实的后备力量为宗旨，强化人才培养、设备引进，加强医护质量工作，继承发扬蒙医蒙药独特的疗效，同时利用现代化医学及先进的医疗仪器设备的诊断优势互为利用，相互结合，形成了“以蒙医蒙药为主、蒙医西医结合治疗”各症的医疗体系。在脑病、心血管病、神经内科、呼吸内科、消化内科、五疗、肝病的蒙医药治疗方面在本地区享有较高的声誉。